Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mccc1Q99MR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Mccc1Q99MR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mccc1Q99MR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mccc1Q99MR8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mccc1Q99MR8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mccc1Q99MR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms