Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SncaipQ99ME3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SncaipQ99ME3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SncaipQ99ME3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncaipQ99ME3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SncaipQ99ME3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SncaipQ99ME3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms