Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms