Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC3

Ndufa10, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa10Q99LC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa10Q99LC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa10Q99LC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa10Q99LC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufa10Q99LC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa10Q99LC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufa10Q99LC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufa10Q99LC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufa10Q99LC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufa10Q99LC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufa10Q99LC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufa10Q99LC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms