Protein–RNA interactions for Protein: Q99JP6

Homer3, Homer protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer3Q99JP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer3Q99JP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer3Q99JP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer3Q99JP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer3Q99JP6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer3Q99JP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Homer3Q99JP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Homer3Q99JP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer3Q99JP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer3Q99JP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer3Q99JP6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer3Q99JP6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer3Q99JP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Homer3Q99JP6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms