Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg5Q99J83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atg5Q99J83 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg5Q99J83 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg5Q99J83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg5Q99J83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg5Q99J83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg5Q99J83 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms