Protein–RNA interactions for Protein: Q925U4

Edem1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem1Q925U4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem1Q925U4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edem1Q925U4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edem1Q925U4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Edem1Q925U4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Edem1Q925U4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Edem1Q925U4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms