Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc8b1Q925Q3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc8b1Q925Q3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8b1Q925Q3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8b1Q925Q3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8b1Q925Q3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms