Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msi2Q920Q6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msi2Q920Q6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msi2Q920Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msi2Q920Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msi2Q920Q6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msi2Q920Q6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms