Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde6cQ91ZQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6cQ91ZQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6cQ91ZQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6cQ91ZQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6cQ91ZQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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