Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Trpm2Q91YD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trpm2Q91YD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trpm2Q91YD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trpm2Q91YD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trpm2Q91YD4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trpm2Q91YD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Trpm2Q91YD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trpm2Q91YD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trpm2Q91YD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trpm2Q91YD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms