Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga12Q91XY7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhga12Q91XY7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhga12Q91XY7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhga12Q91XY7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga12Q91XY7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhga12Q91XY7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms