Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD4

Ftcd, Formimidoyltransferase-cyclodeaminase, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtcdQ91XD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FtcdQ91XD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FtcdQ91XD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FtcdQ91XD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FtcdQ91XD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FtcdQ91XD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FtcdQ91XD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FtcdQ91XD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FtcdQ91XD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FtcdQ91XD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FtcdQ91XD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FtcdQ91XD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms