Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps11Q91W86 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps11Q91W86 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps11Q91W86 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps11Q91W86 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps11Q91W86 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps11Q91W86 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms