Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx9Q91VH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx9Q91VH2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx9Q91VH2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx9Q91VH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx9Q91VH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx9Q91VH2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx9Q91VH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx9Q91VH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms