Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApofQ91V80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApofQ91V80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApofQ91V80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ApofQ91V80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApofQ91V80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApofQ91V80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApofQ91V80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApofQ91V80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApofQ91V80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApofQ91V80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApofQ91V80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms