Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfpqQ8VIJ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfpqQ8VIJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SfpqQ8VIJ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfpqQ8VIJ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfpqQ8VIJ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfpqQ8VIJ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfpqQ8VIJ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfpqQ8VIJ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfpqQ8VIJ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfpqQ8VIJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms