Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Ppargc1bQ8VHJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms