Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clptm1Q8VBZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clptm1Q8VBZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clptm1Q8VBZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clptm1Q8VBZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clptm1Q8VBZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clptm1Q8VBZ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clptm1Q8VBZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms