Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3S6

Exoc1, Exocyst complex component 1, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exoc1Q8R3S6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Exoc1Q8R3S6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Exoc1Q8R3S6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Exoc1Q8R3S6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Exoc1Q8R3S6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Exoc1Q8R3S6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Exoc1Q8R3S6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Exoc1Q8R3S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms