Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim29Q8R2Q0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim29Q8R2Q0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim29Q8R2Q0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim29Q8R2Q0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim29Q8R2Q0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim29Q8R2Q0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms