Protein–RNA interactions for Protein: Q8R239

Tmem268, Transmembrane protein 268, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem268Q8R239 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem268Q8R239 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem268Q8R239 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem268Q8R239 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem268Q8R239 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem268Q8R239 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem268Q8R239 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms