Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b4Q8QZY9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b4Q8QZY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b4Q8QZY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b4Q8QZY9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sf3b4Q8QZY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms