Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Mcfd2Q8K5B2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Mcfd2Q8K5B2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Mcfd2Q8K5B2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mcfd2Q8K5B2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mcfd2Q8K5B2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,4 ms