Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc5Q8K4Z2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc5Q8K4Z2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc5Q8K4Z2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc5Q8K4Z2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc5Q8K4Z2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms