Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z0

Lgi2, Leucine-rich repeat LGI family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi2Q8K4Z0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lgi2Q8K4Z0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgi2Q8K4Z0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lgi2Q8K4Z0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgi2Q8K4Z0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lgi2Q8K4Z0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lgi2Q8K4Z0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgi2Q8K4Z0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgi2Q8K4Z0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgi2Q8K4Z0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lgi2Q8K4Z0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgi2Q8K4Z0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms