Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin28aQ8K3Y3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lin28aQ8K3Y3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lin28aQ8K3Y3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lin28aQ8K3Y3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin28aQ8K3Y3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin28aQ8K3Y3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lin28aQ8K3Y3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin28aQ8K3Y3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin28aQ8K3Y3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms