Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp45Q8K387 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp45Q8K387 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp45Q8K387 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp45Q8K387 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp45Q8K387 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp45Q8K387 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp45Q8K387 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms