Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Acvr1cQ8K348 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Acvr1cQ8K348 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Acvr1cQ8K348 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Acvr1cQ8K348 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acvr1cQ8K348 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acvr1cQ8K348 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acvr1cQ8K348 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms