Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mtmr3Q8K296 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mtmr3Q8K296 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mtmr3Q8K296 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mtmr3Q8K296 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mtmr3Q8K296 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Mtmr3Q8K296 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mtmr3Q8K296 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mtmr3Q8K296 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms