Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk17Q8K0D0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk17Q8K0D0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk17Q8K0D0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdk17Q8K0D0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk17Q8K0D0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk17Q8K0D0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk17Q8K0D0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk17Q8K0D0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms