Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp1Q8K021 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp1Q8K021 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp1Q8K021 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp1Q8K021 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp1Q8K021 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scamp1Q8K021 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scamp1Q8K021 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp1Q8K021 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp1Q8K021 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp1Q8K021 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms