Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trip10Q8CJ53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip10Q8CJ53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip10Q8CJ53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip10Q8CJ53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip10Q8CJ53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms