Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Card11Q8CIS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Card11Q8CIS0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Card11Q8CIS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Card11Q8CIS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Card11Q8CIS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Card11Q8CIS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Card11Q8CIS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Card11Q8CIS0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Card11Q8CIS0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Card11Q8CIS0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Card11Q8CIS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Card11Q8CIS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms