Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI52

Gramd1c, GRAM domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1cQ8CI52 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gramd1cQ8CI52 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gramd1cQ8CI52 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gramd1cQ8CI52 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gramd1cQ8CI52 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gramd1cQ8CI52 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gramd1cQ8CI52 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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