Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph2Q8CGV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph2Q8CGV2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph2Q8CGV2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tph2Q8CGV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tph2Q8CGV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tph2Q8CGV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tph2Q8CGV2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tph2Q8CGV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms