Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ercc8Q8CFD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ercc8Q8CFD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ercc8Q8CFD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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