Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Yod1Q8CB27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yod1Q8CB27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yod1Q8CB27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Yod1Q8CB27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yod1Q8CB27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yod1Q8CB27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms