Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ythdf3Q8BYK6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdf3Q8BYK6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdf3Q8BYK6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ythdf3Q8BYK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdf3Q8BYK6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms