Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW45

E330021D16Rik, RIKEN cDNA E330021D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330021D16RikQ8BW45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330021D16RikQ8BW45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E330021D16RikQ8BW45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330021D16RikQ8BW45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330021D16RikQ8BW45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330021D16RikQ8BW45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330021D16RikQ8BW45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330021D16RikQ8BW45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E330021D16RikQ8BW45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms