Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap20Q8BTU1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap20Q8BTU1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap20Q8BTU1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap20Q8BTU1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap20Q8BTU1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms