Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfia2Q8BSS9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia2Q8BSS9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia2Q8BSS9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia2Q8BSS9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfia2Q8BSS9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms