Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab11fip4Q8BQP8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rab11fip4Q8BQP8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab11fip4Q8BQP8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab11fip4Q8BQP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip4Q8BQP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms