Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cgrrf1Q8BMJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cgrrf1Q8BMJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cgrrf1Q8BMJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cgrrf1Q8BMJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms