Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
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Csgalnact1Q8BJQ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Csgalnact1Q8BJQ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Csgalnact1Q8BJQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Csgalnact1Q8BJQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact1Q8BJQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact1Q8BJQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Csgalnact1Q8BJQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csgalnact1Q8BJQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Csgalnact1Q8BJQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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