Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJM7

Tyw1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw1Q8BJM7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tyw1Q8BJM7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tyw1Q8BJM7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tyw1Q8BJM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tyw1Q8BJM7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tyw1Q8BJM7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tyw1Q8BJM7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tyw1Q8BJM7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tyw1Q8BJM7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tyw1Q8BJM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms