Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg4dQ8BGV9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg4dQ8BGV9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg4dQ8BGV9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4dQ8BGV9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4dQ8BGV9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4dQ8BGV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4dQ8BGV9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4dQ8BGV9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms