Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2af1l4Q8BGJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2af1l4Q8BGJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1l4Q8BGJ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1l4Q8BGJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2af1l4Q8BGJ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1l4Q8BGJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1l4Q8BGJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms