Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim6Q8BGE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim6Q8BGE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim6Q8BGE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim6Q8BGE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim6Q8BGE7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim6Q8BGE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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