Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Katnb1Q8BG40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Katnb1Q8BG40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnb1Q8BG40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnb1Q8BG40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnb1Q8BG40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms